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研究者在薔薇屬植物整合分類(lèi)研究中取得進(jìn)展

[所屬分類(lèi):行業(yè)動(dòng)態(tài)] [發(fā)布時(shí)間:2025-11-17] [發(fā)布人:楊曉燕] [閱讀次數(shù):] [返回]
研究者在薔薇屬植物整合分類(lèi)研究中取得進(jìn)展
作者:楊晨  來(lái)源:中國(guó)科學(xué)報(bào)
山東拓普生物工程有限公司  http://www.xhztyn.cn
中國(guó)科學(xué)院成都生物研究所生物多樣性保護(hù)中心徐波團(tuán)隊(duì)長(zhǎng)期致力于薔薇屬植物的系統(tǒng)分類(lèi)和進(jìn)化生物學(xué)研究。針對(duì)分類(lèi)地位存疑的細(xì)梗薔薇復(fù)合群包括細(xì)梗薔薇、西藏薔薇和秦嶺薔薇,采用整合形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)和基因組學(xué)的多維研究方法,系統(tǒng)解析了該復(fù)合群內(nèi)物種的進(jìn)化關(guān)系和分類(lèi)地位。相關(guān)研究成果于近日發(fā)表在《分子系統(tǒng)發(fā)育與進(jìn)化》上。
研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)廣泛的野外調(diào)查,在細(xì)梗薔薇、西藏薔薇和秦嶺薔薇的整個(gè)分布區(qū)內(nèi)采集了26個(gè)居群,并對(duì)392份標(biāo)本進(jìn)行了詳細(xì)的形態(tài)學(xué)分析。形態(tài)學(xué)主成分分析顯示,三個(gè)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)物種之間不存在明確的形態(tài)學(xué)界限,個(gè)體間呈現(xiàn)高度的形態(tài)連續(xù)變異。生態(tài)位分析進(jìn)一步表明,三個(gè)物種在生態(tài)環(huán)境上也存在高度重疊,缺乏明顯的生態(tài)隔離。
基因組學(xué)分析為解決這一分類(lèi)難題提供了關(guān)鍵證據(jù)。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)全基因組重測(cè)序獲得了近400萬(wàn)個(gè)高質(zhì)量SNP位點(diǎn),系統(tǒng)發(fā)育分析、主成分分析和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析均顯示,三個(gè)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)物種并不構(gòu)成各自的單系群,而是表現(xiàn)出明顯的地理譜系格局。種群間的遺傳分化程度較低,且存在廣泛的基因流,特別是地理相鄰的種群之間。
研究發(fā)現(xiàn),種群的遺傳結(jié)構(gòu)主要反映地理分布模式,遺傳分化主要由地理距離和環(huán)境因子驅(qū)動(dòng)。通過(guò)Mantel test發(fā)現(xiàn),地理隔離能夠解釋約63.5%的遺傳變異,而環(huán)境隔離解釋了53.4%的遺傳變異。
為了解表型變異的遺傳機(jī)制,研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)行了Selective sweep分析,識(shí)別出了與花色變異相關(guān)的花青素合成途徑關(guān)鍵基因。這些基因的表達(dá)差異可能是導(dǎo)致居群間花色從深紅到粉紅再到白色變化的分子機(jī)制。同時(shí),在不同海拔的相鄰居群間,研究還發(fā)現(xiàn)了與花期調(diào)節(jié)、低溫脅迫響應(yīng)和抵御紫外線輻射相關(guān)的基因。
基于形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)和基因組學(xué)的多重證據(jù),研究團(tuán)隊(duì)提出西藏薔薇和秦嶺薔薇應(yīng)作為細(xì)梗薔薇的同物異名處理。
研究強(qiáng)調(diào)了整合分類(lèi)學(xué)方法在解決復(fù)雜分類(lèi)問(wèn)題中的優(yōu)勢(shì),突破了傳統(tǒng)形態(tài)分類(lèi)學(xué)的局限性。隨著DNA提取技術(shù)的日趨成熟和基因組測(cè)序成本的大幅降低,整合分類(lèi)學(xué)方法在解決長(zhǎng)期存在爭(zhēng)議的植物類(lèi)群分類(lèi)問(wèn)題方面具有廣闊的應(yīng)用前景。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1016/j.ympev.2025.108382
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