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山東拓普生物工程有限公司

Shandong Tuopu Biol-Engineering Co.,Ltd

在過(guò)去的15年中，通過(guò)在分子水平上識(shí)別癌癥的驅(qū)動(dòng)因素，對(duì)腫瘤基因組進(jìn)行測(cè)序的能力徹底改變了癌癥的治療方法。但是，由于當(dāng)前基因組測(cè)序的局限性，了解腫瘤中單個(gè)細(xì)胞的遺傳多樣性以及如何影響疾病進(jìn)展仍然是一個(gè)挑戰(zhàn)。

USC研究人員使用基于微流體滴的單細(xì)胞測(cè)序方法，同時(shí)對(duì)近1,500個(gè)單細(xì)胞的基因組進(jìn)行了測(cè)序，揭示了先前隱藏在經(jīng)過(guò)充分研究的黑素瘤細(xì)胞系中的遺傳多樣性。

這項(xiàng)剛剛發(fā)表的研究證明了單細(xì)胞測(cè)序揭示癌細(xì)胞可能進(jìn)化軌跡的能力。

“我們用這種方法來(lái)檢查標(biāo)準(zhǔn)的癌細(xì)胞系，由許多不同的實(shí)驗(yàn)室檢查上千次，”大衛(wèi)·克雷格，博士，在共同的主任說(shuō)翻譯基因組研究所在南加州大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Keck醫(yī)學(xué)院和研究的主要作者�！罢嬲�令人驚訝的是，借助這項(xiàng)技術(shù)，我們發(fā)現(xiàn)了我們所料想不到的復(fù)雜性。該生產(chǎn)線實(shí)際上一直是各種類型細(xì)胞的混合物。重新檢查該生產(chǎn)線數(shù)十年的工作-現(xiàn)在有了這些新信息-我們有了新的對(duì)腫瘤進(jìn)化的見(jiàn)解�！�

高分辨率查看癌癥的復(fù)雜性

當(dāng)前，通常通過(guò)一起而不是單獨(dú)地對(duì)數(shù)百萬(wàn)個(gè)腫瘤細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序來(lái)獲得腫瘤的遺傳信息。盡管這種方法提供了組織遺傳構(gòu)成的廣闊視野，但它可能會(huì)錯(cuò)過(guò)腫瘤中與大多數(shù)細(xì)胞不同的少量癌細(xì)胞。

使用其他分析單個(gè)細(xì)胞DNA的方法，該過(guò)程非常費(fèi)力，僅花費(fèi)數(shù)周時(shí)間即可處理少量細(xì)胞，并且需要大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室所沒(méi)有的資源。

在這項(xiàng)研究中，研究人員使用了一種新興技術(shù)，稱為“單細(xì)胞拷貝數(shù)分析”。由10X Genomics開(kāi)發(fā)的新型分析方法，將這些結(jié)果與歷史方法相結(jié)合。

凱克學(xué)院翻譯基因組學(xué)的首席作者兼助理教授恩里克·維拉克斯奎茲·維拉雷爾(Enrique Velazquez-Villarreal)博士說(shuō)：“我們沒(méi)有分析平均要分析成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞的組織DNA，而是在一個(gè)實(shí)驗(yàn)中分析了將近1500個(gè)細(xì)胞的單個(gè)DNA�！蹦霞又荽髮W(xué)醫(yī)學(xué)系�！耙赃@種較高的分辨率研究癌癥，我們可以發(fā)現(xiàn)低分辨率的批量測(cè)序遺漏的信息�！�

他們的分析顯示，至少有四個(gè)主要的細(xì)胞亞群(也稱為克隆)，有望在癌細(xì)胞系進(jìn)化的某個(gè)時(shí)候從原始癌細(xì)胞發(fā)生突變。

在癌癥組織中鑒定亞克隆的能力可以提供重要的生物學(xué)見(jiàn)解，以了解癌癥如何發(fā)展，如何擴(kuò)散以及為什么會(huì)對(duì)治療產(chǎn)生抵抗力。